April O'Neil relacjonuje z Ellis Island, kiedy w nagłym błysku światła, ona i jej publiczność są świadkami jak Manhattan Island zaczyna się kurczyć. Zły Niszczyciel zagraża światu mocą potężnego złego promienia zwanego Hyperstone. Pomóż Żółwiom Ninja powstrzymać niszczarkę i powstrzymaj jego próbę dominacji nad światem. Powodzenia!