Po ostatniej przygodzie, Mario i Luigi chcieli wziąć zasłużone wakacje na Kokosy. Wszystko było w porządku, ale nagle pewnej nocy, na Wyspach Kokosowych pojawiła się tajemnicza armada! Rano, Yoshi-san, widząc to, pobiegł obudzić Mario i Luigiego. Przygotuj się na nową przygodę z naszą ulubioną postacią z gry wideo, zmierz się z niebezpiecznymi wrogami i zaprowadź pokój na Kokosowe Wyspy.